Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek5Q7TSC3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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