Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nphp3Q7TNH6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nphp3Q7TNH6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nphp3Q7TNH6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nphp3Q7TNH6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nphp3Q7TNH6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nphp3Q7TNH6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nphp3Q7TNH6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nphp3Q7TNH6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nphp3Q7TNH6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms