Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sbno2Q7TNB8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms