Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trappc6aQ78XR0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trappc6aQ78XR0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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