Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HjurpQ6PG16 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms