Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RimklaQ6PFX8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RimklaQ6PFX8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RimklaQ6PFX8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RimklaQ6PFX8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RimklaQ6PFX8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RimklaQ6PFX8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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RimklaQ6PFX8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms