Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Soga3Q6NZL0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Soga3Q6NZL0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms