Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp140Q6NSQ5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms