Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms