Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms