Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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Sh3rf1Q69ZI1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Sh3rf1Q69ZI1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Sh3rf1Q69ZI1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sh3rf1Q69ZI1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sh3rf1Q69ZI1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sh3rf1Q69ZI1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Sh3rf1Q69ZI1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sh3rf1Q69ZI1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sh3rf1Q69ZI1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3rf1Q69ZI1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms