Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms