Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sf1Q64213 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sf1Q64213 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sf1Q64213 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sf1Q64213 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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