Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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