Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms