Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms