Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms