Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttf1Q62187 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttf1Q62187 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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