Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nab1Q61122 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms