Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik1Q60934 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms