Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms