Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms