Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd5Q5VCS6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd5Q5VCS6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms