Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a6Q5U4D8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms