Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms