Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms