Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms