Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim40Q3UWA4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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