Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E130208F15RikQ3UPV3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms