Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser2Q3UHI0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms