Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms