Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms