Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh5Q3TSG4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms