Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc127Q3TC33 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc127Q3TC33 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms