Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb38Q3LR78 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms