Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riiad1Q3KNY5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms