Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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Shroom4Q1W617 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
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Shroom4Q1W617 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
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Shroom4Q1W617 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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