Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms