Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rpusd2Q149F1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rpusd2Q149F1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rpusd2Q149F1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rpusd2Q149F1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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