Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39dQ0VF76 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms