Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2b3Q0VF55 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms