Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zc3h18Q0P678 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zc3h18Q0P678 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms