Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc7a1Q09143 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc7a1Q09143 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms