Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms