Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AmbpQ07456 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms