Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms