Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms