Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CkbQ04447 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms