Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg2Q03517 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms