Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms